群体遗传进化学学习笔记(五)选择清除分析运行实操2023-02-14学习约 1645 字 预计阅读 4 分钟从群体遗传学的各个概念,到群体遗传学结构分析的各个步骤,可以看出,这些值的计算基本都是基于vcf文件,因此重测序分析的学习也很重要,不过既然阅读更多
群体遗传学学习笔记(四) 关于群体结构STRCTURE的一些分析实操记录2023-02-13学习约 945 字 预计阅读 2 分钟接着我们上次做的PCA分析,可以看到,每个不同的分析都是放在不同的文件夹下进行,这次做两个分析,一个是admixture群体结构分析,一个是阅读更多
群体遗传进化分析笔记(三) 关于群体选择消除分析的一些概念知识2023-02-12学习约 2388 字 预计阅读 5 分钟选择清除分析(select sweep)是我们研究群体进化过程中哪些突变有利哪些突变受筛选的一种有效的分析方式,帮助我们筛选一些群体突变基因。阅读更多
群体遗传进化分析笔记(二)2023-02-11学习约 1195 字 预计阅读 3 分钟本篇为跟着组学大讲堂的群体遗传学课程的跟练记录,上一篇记录了相关分析背景知识,因此这一篇来实操一下。 原始数据目录结构 接下来进行一些环境变量的阅读更多
群体遗传进化分析笔记(一)2023-02-11学习约 1179 字 预计阅读 3 分钟群体遗传学涉及几个进化学说,包括中性学说、正选择vs负选择这些,传统群体遗传学是基于观察到的等位基因频率与预期频率的分析。近些年来群体遗传进阅读更多